स्वास्थ्य देखभाल का लागत-लाभ विश्लेषण सही ढंग से करना मुश्किल है, या भावनात्मक उलझाव से अलग है। उदाहरण के लिए, धूम्रपान या मोटापे की रोकथाम को उन विकल्पों से पैदा होने वाली बीमारियों के इलाज की लागतों को बचाने की क्षमता के रूप में प्रस्तुत किया गया है। फिर भी, यदि ये बीमारियां घातक हैं या जीवन छोटा है, तो वे अपने जीवन के बाकी हिस्सों से उस व्यक्ति के इलाज के लिए आखिरी लागत को कम कर सकते हैं, और यह संभव है कि वे हर बीमारी के रूप में इलाज के लिए महंगी एक बीमारी से मर जाएंगे वे एक स्वस्थ जीवन शैली से बच गए
यह एक कराधान या बीमा राजस्व के नुकसान के प्रति संतुलित होना चाहिए जो एक व्यक्ति के पास अधिक उत्पादक (यानी काम और कर या बीमा-भुगतान) जीवन हो सकता है। लागत-लाभ विश्लेषण बहुत ही अलग होगा, इस पर निर्भर करते हुए कि क्या आप पूरे जीवन के लेखांकन को अपनाना चाहते हैं, या हर महीने एक बीमा प्रणाली पर डेबिट और क्रेडिट के रूप में मानते हैं। कराधान द्वारा वित्तपोषित प्रणाली में, सबसे बड़ा लाभ लाभ उन लोगों के कार्यशील जीवन को बनाए रखने से आता है जो भविष्य में सबसे अधिक कर का भुगतान करने की संभावना रखते हैं, यानी युवा और अमीर
कुछ राजनेताओं इस तरह लागत की बड़ी तस्वीर पेश करने की हिम्मत करेंगे, क्योंकि उन्हें कठोर कहा जाएगा। फिर भी, परिदृश्य के पीछे, अपने बजट को संतुलित करने के लिए एक जिम्मेदार सरकार लागत विश्लेषण का प्रदर्शन करनी चाहिए; यह संभावना नहीं है, हालांकि, पूरी तरह से लागत प्रभावी मार्ग लेने के लिए। यह किसी अन्य मॉडल के अनुसार सबसे अच्छी स्वास्थ्य देखभाल प्रदान करना चुन सकता है, लेकिन इसकी लागत अभी भी अनुमानित और वित्त पोषित होना चाहिए, और सबसे अच्छी तरह से कोई विवादित परिभाषा नहीं है
स्वास्थ्य देखभाल की गुणवत्ता की परिभाषा के निर्माण में, एक निहितार्थ है कि गुणवत्ता को मापा जा सकता है वास्तव में, चिकित्सा की अनिश्चितता के कारण न केवल स्वास्थ्य देखभाल की प्रभावशीलता को मापना बेहद मुश्किल है, लेकिन जीवन की गुणवत्ता जैसे अमूर्त मात्रा के कारण। यह उन प्रणालियों का नेतृत्व करने की संभावना है जो केवल मापने में आसान है (जैसे कि जीवन की लंबाई, प्रतीक्षा समय या संक्रमण दर)। नतीजतन, पुरानी, गैर-घातक परिस्थितियों के इलाज के महत्व या, गंभीर रूप से बीमारी के लिए सर्वोत्तम देखभाल प्रदान करने के महत्व को कम किया जा सकता है। इस प्रकार, प्रणाली नीचे जाने के लिए व्यक्तिगत संतुष्टि के लिए संभव है, जबकि मेट्रिक्स ऊपर जाता है