अन्य एमिनोग्लिकोसाइड्स की तरह, टोब्रैमिसिन ऑटोटॉक्सिक है: यह सुनवाई हानि, या संतुलन की हानि या आनुवंशिक रूप से अतिसंवेदनशील व्यक्तियों में दोनों के कारण हो सकता है। ये व्यक्ति सामान्य रूप से हानिरहित आनुवंशिक उत्परिवर्तन लेते हैं जो कोनोबल कोशिकाएं जैसे कोब्रैमाइसिन को कोक्लेअर कोशिकाओं को प्रभावित करने की अनुमति देता है। अमीनोग्लिक्साइड प्रेरित ओटोटॉक्सिसिटी आमतौर पर अपरिवर्तनीय है।
सभी एमिनो ग्लाइकोसाइड के साथ, टोब्रैमिसिन भी नेफ्रोटॉक्सिक है, यह किडनी के ऊतक को नुकसान पहुंचा सकता है या नष्ट कर सकता है [3]। यह प्रभाव विशेष रूप से चिंताजनक हो सकता है जब कई खुराक एक उपचार के दौरान जमा हो जाते हैं या जब किडनी नींद के दौरान ट्यूबलर पुनर्योजीशन बढ़ाकर मूत्र को केंद्रित करता है। पर्याप्त हाइड्रेशन अतिरिक्त नेफ्रोटॉक्सिसिटी और गुर्दे के कार्य के बाद के नुकसान को रोकने में मदद कर सकता है। इन कारणों के लिए कैंसर के टूब्रैमिसिन को शरीर के वजन से सावधानीपूर्वक डास होने की आवश्यकता है, और इसकी सीरम एकाग्रता की निगरानी की जाती है। इस प्रकार Tobramycin एक संकीर्ण चिकित्सीय सूचकांक के साथ एक दवा होने के लिए कहा जाता है